أنزلت المحكمة العسكرية الدائمة برئاسة العميد الركن حسين عبد الله، عقوبة الأشغال الشاقة مدة ثلاث سنوات، بحق محمود كوجا.
كما جرّدته من حقوقه المدنية وألزمته بتقديم بندقية حربية، بعدما أدانته "بالمشاركة بأعمال عسكرية وارهابية ضدّ الجيش اللبناني، ما تسبب باستشهاد عسكريين وجرح آخرين".